细胞数：胚胎发育到第3天时，通常理想的细胞数为68个。如果胚胎细胞数少于6个或超过10个，可能会影响其着床率。细胞均匀度：细胞大小是否均匀也是评估胚胎质量的重要指标。细胞大小不一的胚胎，其发育潜能较低。碎片率：胚胎内的碎片是指细胞分裂过程中产生的非正常细胞物质。碎片率越低，胚胎的质量越好。一般认为，碎片率低于10%的胚胎属于优质胚胎。
囊胚形成时间：胚胎在培养至第5天或第6天时，应达到囊胚阶段。囊胚的形成时间和形态对于评估胚胎质量至关重要。高质量的囊胚通常在第5天形成，且内细胞团和滋养层细胞发育良好。扩张等级：囊胚的扩张等级从1到6，等级越高，表示囊胚的扩张程度越大，质量越好。PGT：通过PGT技术，可以检测胚胎是否存在染色体异常或遗传疾病。正常的染色体数目和结构是判断胚胎质量的重要标准之一。PGTA主要用于检测染色体数目异常，而PGTM则用于检测特定的单基因遗传病。
代谢产物分析：通过检测胚胎培养液中的代谢产物，可以评估胚胎的代谢活性。代谢活性高的胚胎，其发育潜能通常较好。例如，葡萄糖、乳酸等代谢产物的浓度可以评估指标。综合评分：许多生殖中心会采用综合评分系统来评估胚胎质量。评分系统通常结合上述多个指标，如细胞数、细胞均匀度、碎片率、囊胚形成时间、扩张等级等，给出一个综合评分。评分越高，胚胎质量越好。医生的经验：经验丰富的生殖医学专家在评估胚胎质量时，往往会结合临床经验和直觉。
医生会根据胚胎的外观、发育情况以及患者的具体情况，做出更为全面的判断。年龄：女性年龄是影响胚胎质量的重要因素。年轻女性的卵子质量通常较好，胚胎的发育潜力也更高。既往生育史：患者的既往生育史、流产史等也会对胚胎质量产生影响。多次流产或不孕不育的患者，其胚胎质量可能较差。生活方式：吸烟、饮酒、肥胖等不良生活习惯会降低胚胎质量。保持健康的生活方式有助于提高胚胎质量。